De forbannede årene 2 er en sterk og dramatisk oppfølger til De forbannede årene. Filmen følger familien Skov fra våren 1943 til sommeren 1945, da Danmark igjen blir fritt.
Familien er splittet. Aksel har sluttet seg til motstandsbevegelsen og gått under jorden. Fra å være en idealistisk amatør utvikler han seg til å bli en hardbarket partisan. Karl kjemper for å redde livsverket sitt under stadig vanskeligere forhold. Når samlingsregjeringen kollapser, står han plutselig uten politisk støtte og må ta alle forholdsregler for å sikre familiens fremtid – også etter krigen. Det skaper stor belastning på forholdet til Eva, som hele tiden har hatt vanskeligheter med ektemannens samarbeid med okkupasjonsmakten.
Den økende motstanden mot okkupasjonen og tyskernes økte brutalitet får fatale følger for familien…